该剧主要讲述了民国时期因水运而兴旺的白河镇恐怖案件频发：十二生肖挖心案、人肉包子案、真凶替死鬼案、县长被杀案、未婚夫被杀案等。李正九人称“九叔”，善于探查民间诡事，而其一年前他的兄长离奇被杀，九叔怀疑这一切与白河镇的恐怖案件有关
明宣德五年，苏州遭遇洪灾，朝廷命清官况钟赴任。他微服暗访，发现赈灾粮款被贪、官商勾结，且在贪腐案中还隐藏着人命关天的冤案，最终况钟以智破局，与贪腐势力巧妙周旋，最终平反冤狱，智擒“十五贯”案真凶娄阿鼠，昭雪苏戍娟、熊友兰。同时整顿了苏州吏治，设局瓮中捉鳖，揪出核心贪腐势力长洲知县何维桢、北望侯李鹤鸣，并追回赃款用于安抚灾民、重建家园。况钟“清风铁面”之名远扬，百姓挽留，留任十三载，卒后立祠，与包拯、海瑞并称“三大青天”。
